《南昌大学学报》分为人文社会科学版、 工科版、 理科版、 医学版。

《南昌大学学报人文社会科学版》主要刊登哲学、经济学、法学、文学、史学、新闻、艺术、语言文字、图书情报学等人文社会科学各学科的最新科研成果。常设栏目有马克思主义研究、道德与人生、政治与社会、哲学与时代、经济与管理、法学与法治、新闻与传播、历史与文化、诗学纵横、文艺思潮与创作评论、当代社会保障研究、语言与文字、教育与科学、学术争鸣园地等，“道德与人生”栏目获全国高校社科期刊“优秀栏目”。 “诗学纵横”栏目获全国高校社科期刊“特色栏目”。

《南昌大学学报(工科版)》是南昌大学主办的工程技术类综合性学术期刊，季刊，国内外公开发行。1964年创刊，原名《江西工学院学报》，1985年改为《江西工业大学学报》，1993年更为现名。本刊坚持“二为”方向、“双百”方针，展示高水平研究成果，扶持学术人才成长，促进学术交流，为国家和地方社会发展经济建设服务。主要刊载化工、环境、机械、食品、自动化、电子、计算机、水利、水电、土木建筑工程、材料科学与数理学科等方面的学术论文和研究报告，积极报道科研单位、高等院校等工程技术类的最新研究成果。本刊为中国科技论文统计源核心期刊。

《南昌大学学报(理科版)》是南昌大学主办的自然科学综合性学术理论刊物，双月刊，公开发行。1963年创刊，原名《江西大学学报（自然科学版）》，1993年更为现名。本刊坚持“二为”方向、“双百”方针，展示高水平研究成果，扶持学术人才成长，促进学术交流，为国家和地方社会发展经济建设服务。主要刊登数学、物理学、化学、生物学、食品科学、电子科学、计算机科学、材料科学、管理科学等学科基础理论研究和应用基础研究方面的研究报告、简报、快报、等学术论文，注重反映南昌大学理科各学科的最新科研成果，促进学术交流。本刊为中文核心期刊（综合性科学技术类）和中国科技论文统计用刊源之一。

《南昌大学学报（医学版）》（原江西医学院学报）是一份由南昌大学主管、主办的综合性医药卫生类学术期刊，创刊于1956年11月，双月刊，双月末出版，国内外公开发行。 本刊坚持“二为”方向、“双百”方针，展示高水平研究成果，扶持学术人才成长，促进学术交流，为国家和地方社会发展经济建设服务。主要报道医学研究领域新的科研成果和研究动态，以医学教学、科研、医疗工作者为主要读者对象。设有基础医学、临床医学、综合报道、综述４个固定栏目，以及专题研究、方法•技术、调查研究、病例报告、科研信息、读者•作者•编者６个机动栏目。作为江西省医学期刊的一个重要组成部分，该刊始终注重稿件学术质量建设，克服期刊在定位上的内向性、内容上的综合性和地方性院校的局限性，在传播医学科研信息、推动医学科研发展方面起到了重要的的作用。